MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 10909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007765	TTGC	2	8	221	228	0 %	50 %	25 %	25 %	86360279
2	NC_007765	CGG	2	6	231	236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
3	NC_007765	CGG	2	6	243	248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
4	NC_007765	CTT	2	6	310	315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360279
5	NC_007765	ACG	2	6	378	383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360279
6	NC_007765	TGC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360279
7	NC_007765	AGGGGA	2	12	520	531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360279
8	NC_007765	CGG	2	6	558	563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
9	NC_007765	CGA	3	9	577	585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360279
10	NC_007765	CGC	2	6	603	608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360279
11	NC_007765	CGC	2	6	610	615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360279
12	NC_007765	GAG	2	6	695	700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360279
13	NC_007765	CGA	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360279
14	NC_007765	GAG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360279
15	NC_007765	TGC	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360279
16	NC_007765	GCC	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360279
17	NC_007765	GCG	2	6	880	885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
18	NC_007765	CGG	2	6	898	903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
19	NC_007765	GC	3	6	925	930	0 %	0 %	50 %	50 %	86360279
20	NC_007765	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
21	NC_007765	GCG	2	6	994	999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
22	NC_007765	GCTG	2	8	1051	1058	0 %	25 %	50 %	25 %	86360279
23	NC_007765	CGG	3	9	1059	1067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
24	NC_007765	GC	3	6	1097	1102	0 %	0 %	50 %	50 %	86360279
25	NC_007765	GCC	2	6	1128	1133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360279
26	NC_007765	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360279
27	NC_007765	CGG	2	6	1191	1196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
28	NC_007765	CGCC	2	8	1204	1211	0 %	0 %	25 %	75 %	86360279
29	NC_007765	CGC	2	6	1224	1229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360279
30	NC_007765	GCG	2	6	1230	1235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360279
31	NC_007765	ATC	2	6	1304	1309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360279
32	NC_007765	AGAGCG	2	12	1492	1503	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86360280
33	NC_007765	CGA	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360280
34	NC_007765	GAC	2	6	1601	1606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360280
35	NC_007765	GC	3	6	1636	1641	0 %	0 %	50 %	50 %	86360280
36	NC_007765	GAT	3	9	1673	1681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360280
37	NC_007765	CAT	2	6	1694	1699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360280
38	NC_007765	TCG	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360280
39	NC_007765	TGG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360280
40	NC_007765	GGC	2	6	1769	1774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360280
41	NC_007765	TGA	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360280
42	NC_007765	GAA	3	9	1913	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360280
43	NC_007765	GCG	2	6	1933	1938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360280
44	NC_007765	CAC	2	6	1946	1951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360280
45	NC_007765	GCG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360280
46	NC_007765	CGA	2	6	2002	2007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360280
47	NC_007765	CGA	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360280
48	NC_007765	GCA	2	6	2062	2067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360280
49	NC_007765	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360280
50	NC_007765	AG	3	6	2169	2174	50 %	0 %	50 %	0 %	86360281
51	NC_007765	GCC	2	6	2192	2197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360281
52	NC_007765	GGC	2	6	2263	2268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360281
53	NC_007765	TCCG	2	8	2350	2357	0 %	25 %	25 %	50 %	86360281
54	NC_007765	TCG	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360281
55	NC_007765	AGGC	2	8	2562	2569	25 %	0 %	50 %	25 %	86360281
56	NC_007765	CGG	2	6	2634	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360281
57	NC_007765	CGG	2	6	2655	2660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360281
58	NC_007765	CGG	2	6	2714	2719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360281
59	NC_007765	GGC	2	6	2739	2744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360281
60	NC_007765	GGC	2	6	2812	2817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360281
61	NC_007765	GCG	2	6	2857	2862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360281
62	NC_007765	CGA	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360281
63	NC_007765	CG	3	6	2965	2970	0 %	0 %	50 %	50 %	86360282
64	NC_007765	TCT	2	6	2974	2979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360282
65	NC_007765	GC	3	6	2998	3003	0 %	0 %	50 %	50 %	86360282
66	NC_007765	TCC	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360282
67	NC_007765	GAA	2	6	3128	3133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360282
68	NC_007765	CTG	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360282
69	NC_007765	GGCC	2	8	3172	3179	0 %	0 %	50 %	50 %	86360282
70	NC_007765	TCG	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360282
71	NC_007765	GGC	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360282
72	NC_007765	CGAT	2	8	3249	3256	25 %	25 %	25 %	25 %	86360282
73	NC_007765	CAG	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360282
74	NC_007765	GCC	2	6	3299	3304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360282
75	NC_007765	CTT	3	9	3317	3325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360282
76	NC_007765	GC	3	6	3333	3338	0 %	0 %	50 %	50 %	86360282
77	NC_007765	CAT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360282
78	NC_007765	GC	5	10	3388	3397	0 %	0 %	50 %	50 %	86360282
79	NC_007765	GCG	2	6	3411	3416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360282
80	NC_007765	AAG	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360283
81	NC_007765	CCA	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360283
82	NC_007765	AAG	2	6	3745	3750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360283
83	NC_007765	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360283
84	NC_007765	CGA	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360283
85	NC_007765	CCG	2	6	3884	3889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360283
86	NC_007765	TC	3	6	3902	3907	0 %	50 %	0 %	50 %	86360283
87	NC_007765	GCC	2	6	3951	3956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360283
88	NC_007765	TTC	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360283
89	NC_007765	CCGG	2	8	3986	3993	0 %	0 %	50 %	50 %	86360284
90	NC_007765	GGCA	2	8	4004	4011	25 %	0 %	50 %	25 %	86360284
91	NC_007765	GCG	2	6	4032	4037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360284
92	NC_007765	CAG	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360284
93	NC_007765	AGGC	2	8	4299	4306	25 %	0 %	50 %	25 %	86360284
94	NC_007765	CGA	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
95	NC_007765	CGC	4	12	4410	4421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360285
96	NC_007765	ATC	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360285
97	NC_007765	CAG	3	9	4434	4442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
98	NC_007765	TCG	2	6	4535	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360285
99	NC_007765	GCC	2	6	4550	4555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360285
100	NC_007765	CGA	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
101	NC_007765	GC	3	6	4717	4722	0 %	0 %	50 %	50 %	86360285
102	NC_007765	CTT	2	6	4740	4745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360285
103	NC_007765	GC	4	8	4801	4808	0 %	0 %	50 %	50 %	86360285
104	NC_007765	ATG	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360285
105	NC_007765	CGGCGA	2	12	4901	4912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360285
106	NC_007765	TCT	2	6	4982	4987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360285
107	NC_007765	CGA	2	6	5111	5116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
108	NC_007765	CGC	2	6	5123	5128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360285
109	NC_007765	TTC	2	6	5130	5135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360285
110	NC_007765	GAT	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360285
111	NC_007765	CAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
112	NC_007765	CCG	2	6	5224	5229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360285
113	NC_007765	CGA	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
114	NC_007765	GCGCC	2	10	5356	5365	0 %	0 %	40 %	60 %	86360285
115	NC_007765	GAT	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360285
116	NC_007765	ACGGCG	2	12	5431	5442	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360285
117	NC_007765	CAG	2	6	5445	5450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
118	NC_007765	GAC	3	9	5514	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
119	NC_007765	GAA	2	6	5532	5537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360285
120	NC_007765	CGA	2	6	5603	5608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
121	NC_007765	TTG	2	6	5668	5673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360285
122	NC_007765	GCC	2	6	5679	5684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360285
123	NC_007765	ATC	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360285
124	NC_007765	CGA	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
125	NC_007765	ACGC	2	8	5802	5809	25 %	0 %	25 %	50 %	86360285
126	NC_007765	CCG	2	6	5874	5879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360285
127	NC_007765	CG	3	6	5933	5938	0 %	0 %	50 %	50 %	86360285
128	NC_007765	CGA	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
129	NC_007765	CGA	2	6	5975	5980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
130	NC_007765	GCC	3	9	5986	5994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360285
131	NC_007765	CGA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360285
132	NC_007765	GA	3	6	6138	6143	50 %	0 %	50 %	0 %	86360285
133	NC_007765	GAA	2	6	6159	6164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360285
134	NC_007765	GCC	2	6	6172	6177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360285
135	NC_007765	CAC	2	6	6183	6188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360285
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267	NC_007765	CGG	2	6	12501	12506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360288
268	NC_007765	CTG	2	6	12586	12591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360288
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270	NC_007765	GCG	2	6	12681	12686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360288
271	NC_007765	ATC	2	6	12701	12706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360288
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273	NC_007765	CGC	2	6	12736	12741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360288
274	NC_007765	CTT	2	6	12742	12747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360288
275	NC_007765	GTCG	2	8	12802	12809	0 %	25 %	50 %	25 %	86360288
276	NC_007765	ATTTC	2	10	12873	12882	20 %	60 %	0 %	20 %	86360288
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300	NC_007765	CG	3	6	14025	14030	0 %	0 %	50 %	50 %	86360288
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394	NC_007765	TCG	2	6	19142	19147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360291
395	NC_007765	CGGC	2	8	19185	19192	0 %	0 %	50 %	50 %	86360291
396	NC_007765	CGT	2	6	19218	19223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360291
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500	NC_007765	GGC	3	9	23862	23870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360295

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